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Apple基因组序列有助于育种新品种的发表(图)

2019-01-05 10:37:13

  苹果的高质量基因组序列近日在的Nature Genetics上由国际科学家团队发表,其中包括荷兰瓦赫宁根大学和研究所的研究人员。该序列的出版有助于更快和更有针对性地培育新的苹果品种,其具有增加的抗病性,改善的生产性状和更好的果实品质。有了这个,从环境和财务的角度来看,这些结果支持了苹果果实的更可持续生产。

  Apple基因组序列有助于育种新品种的发表

  基因组序列由来自法国,意大利,德国,荷兰和南非的国际研究机构联合组织。基因组数据的高质量,超过4.2万个推定的基因,是使用最新测序技术的结果,这些技术产生了长长的DNA序列,非常特定的苹果品种,以及苹果开发的信息量最大的遗传连锁图谱。在早期的研究中。

  基因组序列为苹果基因组的组织提供了新的见解。已经通过RNA测序验证了42,000个推定基因中的93%。这些知识可用于鉴定控制目标性状的基因,以及用于加速新品种育种的基于DNA的诊断测试的开发。

  使用所谓的二单倍体苹果品种对于本研究的成功至关重要。苹果是一种异交物种,使其基因组杂合。此外,苹果起源于两个不同物种之间的杂交,其与全基因组复制相结合。因此,每种常规苹果品种的每个DNA序列最多有四种变体。本研究中使用的二单倍体变种是特殊的,因为它每个序列只有两个变体。这导致显着的复杂性降低,这使得可以产生非常高质量的基因组序列。

  苹果基因组的新见解包括对苹果17条染色体中重复模式的清晰认识。这有助于鉴定具有类似功能的基因拷贝。接下来,组装了所谓的重复区域。迄今为止这些未表征的苹果基因组区域可能参与调节基因表达。最后,发现了一种新的重复序列,可能对着丝粒特异,这可能会导致染色体分裂和复制的新见解。

  该研究由INRA-Angers的Etienne Bucher协调。瓦赫宁根大学和研究所的研究人员对基因组测序,基因组图谱和组装做出了贡献,运用他们在生物信息学方面的经验和技能,并通过早期获得苹果中高质量的参考遗传连锁图谱。

  瓦赫宁根大学和研究院开发了新的苹果品种,产生了顶级品种'Elstar','Santana'和最近发布的'Natyra'。后两者适用于生物生产,因为这些品种具有抗病性。此外,'Santana'适合大多数患有轻度苹果过敏的人食用。

  Wageningen将利用苹果DNA中的新见解进行有针对性的新品种选育。

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